בתקופת מלחמת השחרור עמדה כל פעילותה של קופת חולים הכללית בסימן המאבק המלחמתי. מוסדות הקופה - בתי החולים ובתי ההבראה, הועמדו כולם לעזרת לוחמי החזית ובני משפחותיהם בעורף. כ-250 מבין עובדי קופ"ח גוייסו לצבא. עשרות עובדים נוספים של הקופה הועמדו לרשות משרד הבריאות של המדינה.
