ישיבת כפר גנים - המוסד הדתי הגדול ביותר בפ"ת, אשר זכה בפרס חינוך, משלבת בגישתה חינוך לשמירת תורה ומצוות בצד חינוך לכל תחומי העשייה תוך התחשבות בצרכים של הזמן המודרני.
הישיבה החלה דרכה בשנת 1962, כאשר פרט לקופ"ח רוטשילד ולפרדסים המוריקים מסביב לא התפתחה עדיין התשתית לקיומו של היישוב. הישיבה הוקמה ע"י הרב נחמן צוקר ורעייתו שרה, ובעזרת התלמידים.
בישיבה מקדישים תשומת לב רבה לנושא תרומה לחברה. מתקיימת פעילות התנדבותית שוטפת למען הזולת, בעיקר לקשישים ולבתי-חולים. המקהלה, מופיעה בין השאר בפני קשישים, הופיעה פעמיים באירופה וכן במופעים חינוכיים ותרבותיים בארץ.
הישיבה מונה כ-400 תלמידים בחטיבת הביניים והתיכון.
בתיכון מוצעות מגמות מגוונות: הומנית, ריאלית, ביולוגית, פיסיקלית ומחשבים. חדר המחשבים הוא מהמשוכללים בעולם. רמת הישיבה היא מהגבוהות בארץ. אחד מהישגיה הוא בתחום המתמטיקה. בשילוב עם אוניברסיטת בר-אילן מתבצע בישיבה פרוייקט ייחודי בארץ.
הישיבה גאה בבוגריה. רבים מהם בעלי תפקידים בכירים: רבנים, רופאים, מנהלי בתי-ספר, מנהלי בנקים, עורכי דין, רבנים צבאיים ועוד.
